コメントありがとうございます。
長期間、サイトを更新する時間が取れず、確認が遅くなりましたこと、お詫びいたします。申し訳ありませんでした。

すでに解決済みかもしれませんが、見解をお伝えさせていただきます。

＞先日から右耳のイヤホンのみ充電ケースに入れても機能ボタンを押しても反応がなくなってしまいました。
＞しかし左耳のイヤホンは特にそう言った不具合もなく、充電ケースに問題があるのかと思い、試しに左耳のイヤホンを本来右耳のイヤホンを入れるところに入れてみた所、反応がありました。

こちらの症状ですが、いただいた文面から考えられる可能性としては、

・右耳か左耳、もしくは両方の故障（この場合、ヤマハへ修理に出すか、買い換えが現実的になりそうです）
・充電ケースの不具合（端子の汚れなど）により右耳側のみ充電ができない状態

などが思い浮かびました。

充電ケースの端子部分に汚れや接触不良などがあると、イヤホンを充電ケースに入れてもうまく充電が行われません。
仮に充電ができていなかった場合、片耳だけイヤホンが反応しなかったことや、充電ケースの反対側の部分へイヤホンを入れて動作した状況に当てはまります。

もし充電ケースの不具合だった場合は、メガネクロス（マイクロファイバー布）など柔らかい布でよく拭くと接触が復活することがあります。

お返事が遅くなりましたこと、重ねてお詫びいたします。何かのお役に立ちましたら幸いです。